Постановлением Совета Министров СССР от 30 .09.1946 года № 2199-898 образовано ЦКБ-56 (организация п/я 40). Приказом министра судостроительной промышленности СССР от 31.01.1966 года № 0056 ЦКБ было присвоено открытое наименование  Центральное конструкторское бюро «Черноморец» и условное – «Предприятие п/я Г- 4217». 1 июля 1993 года  ЦКБ «Черноморец»  переименовано в ГП ЦКБ «Черноморец». С 11.06.2007 года ГП ЦКБ «Черноморец» - правопреемник Государственного предприятия Черноморский научно-исследовательский институт технологии судостроения   (ГП ЧНИИ ТС). Постановлением Правительства города федерального значения Севастополя от 10.12.2014 № 562 создано «Государственное унитарное предприятие «Центральное конструкторское бюро «Черноморец».                                                                                                 

С середины 50-х годов ЦКБ выполняет работы по переоборудованию боевых кораблей. Наиболее крупными проектами в этой области стали работы по переоборудованию крейсера «Ворошилов» и крейсера «Жданов». В 60-е годы развивается новое направление - проектирование кораблей. Разработаны и построены: минно-сетевые заградители - «Припять», «Сухона», «Вычегда», исследовательское судно «Невельской», корабли радиотехнического наблюдения - «Крым», «Кавказ», «Приморье», корабль управления «Славутич» пр. 12884 впоследствии выполнена модернизация пр.58120, автономная погружающаяся платформа для транспортировки судов на воздушной подушке типа «Зубр» пр.50300, которая может использоваться и как плавучий док, бонопостановщик пр. 50330 и пожарное судно пр. 50320. Разработана ремонтная документация для кораблей проектов 1124М и 11351.  Специалисты ЦКБ, привлекались к разработке ремонтной документации или оказания технической консультативной помощи специалистам ВМС зарубежных стран, которые в своем флоте имели корабли и подводные лодки построенные в Советском Союзе и требовали ремонта – это Египет, Алжир. В конце 80-х годов специалисты ЦКБ оказывали научно-техническую помощь специалистам Индии при ремонте подводных лодок. В 2002 году для Вьетнама был разработан проект на постройку цеха для капитального ремонта корабельной спецтехники. Но основной работой на экспорт в последнее десятилетие была разработка ремонтной нормативно-технической документации для кораблей и подводных лодок Китая, Вьетнама и Индии. Одновременно с выполнением оборонных заказов обеспечивался ремонт судов морского и рыбопромыслового флота. В короткие межрейсовые периоды проходили ремонт и модернизацию суда китобойной флотилии «Слава», «Советская Украина».  В конце 70-х годов выполнен ряд проектов по переоборудованию гидрографических судов в суда носители подводных аппаратов.